Le Centre Hospitalier de Perpignan est par sa taille, son activité et son plateau technique, le 1er établissement public de santé des Pyrénées Orientales, dont il assure le tiers de l'activité de court séjour, médecine, chirurgie et gynécologie-obstétrique. Son offre de soins complète répond aux besoins de la population du territoire de santé concentrée essentiellement sur l'agglomération de Perpignan. Il développe par ailleurs de multiples coopérations (GCS) avec les établissements sanitaires et médico-sociaux public et privés de la région pour s'inscrire dans les objectifs fixés par le PRS.
Depuis juillet 2016, le Centre Hospitalier de Perpignan est l'établissement support du GHT "Aude-Pyrénées" comprenant les hôpitaux des Pyrénées Orientales et de l'Est Audois dont l'objectif de coopération repose sur le Projet Médical Partagé.