3ème établissement de santé et 1er centre hospitalier non universitaire de la région PACA, l'organisation du C.H.I.T.S se dessine sur trois sites principaux avec : l'hôpital Sainte Musse à Toulon, établissement pivot pour l'ensemble du territoire de santé desservant les 500 000 habitants de la grande agglomération toulonnaise. Il est le lieu d'implantation d'un plateau technique lourd, dont la réanimation, la néonatalogie, le SAMU 83 et les urgences, permettant de poursuivre, en les développant, de nombreuses activités médicales et chirurgicales, ainsi que les activités de psychiatrie.

L'hôpital de La Seyne sur mer est confirmé dans sa vocation de proximité pour l'Ouest Var avec :
- un centre de périnatalité
- des unités d'hospitalisation de médecine polyvalente
- un centre d'explorations fonctionnelles et de consultations
- un service de rééducation fonctionnelle et d'éveil des comas
- une unité de soins palliatif
- une unité de soins de longue durée, comportant une unité d'hébergement renforcée (UHR)
- des services de psychiatrie adulte et infanto-juvénile
- des structures médico-sociales : Centre d'Action Médico-Sociale Précoce (CAMSP) et Etablissement d'Hébergement pour Personnes Agées Dépendantes (EHPAD).
En lien avec un plateau technique de pointe, les services des urgences et de radiologie sont complémentaires des autres sites du Centre Hospitalier.

A La Garde, l'hôpital Clemenceau est spécialisé sur les questions du grand âge. Il comprend des services de :
- médecine à orientation gériatrique
- de soins de suite et de réadaptation, dont une unité de réhabilitation cognitivo-comportementale" (Plan Alzheimer)
- équipe mobile de gériatrie
- hôpital de jour
- unité de soins de longue durée
- Structure médico-sociale : Etablissement d'Hébergement pour Personnes Agées Dépendantes (EHPAD)